由于海洋污染、船艇的意外碰撞、过度捕捞以及在捕捞其他鱼类时的意外捕获屋，特别是大屋捕捞金枪鱼时，都对蓝 枪鱼的生存产生了重大的威胁。曰本等国家每年猎获超过1000吨蓝枪鱼。
虽然在美国海岸200海浬内捕获的大西洋蓝枪鱼需要放生，但放生后它们的生存率却十分低。蓝枪鱼被世界自然保护 联盟（IUCN )濒危物种红色名录于2011年列为近危（NT)。